Los programas de conservación llevados a cabo por el Zoológico Nacional contribuyen a: la educación pública en materias de conservación de la biodiversidad, a la investigación y obtención de conocimiento de biología animal aplicada a su cuidado, manejo, bienestar y conservación, así como a proveer de una reserva genética para las poblaciones silvestres. A través de la estrategia de conservación ex situ o bajo cuidado humano, se han impedido extinciones de muchas especies a nivel global, y se han realizado reintroducciones exitosas a la naturaleza de animales rehabilitados o criados bajo cuidado humano para un número creciente de especies. También el trabajo con las comunidades locales asociadas ha desempeñado un papel fundamental en cada programa de conservación que ha llevado a cabo el Zoológico Nacional de Chile, siendo una instancia de aprendizaje y compartir de saberes en el que nos convencimos de que el componente educativo y la vinculación emocional de las comunidades son fundamentales para el éxito de estos programas..